إن بنك البذور في حديقة النباتات العمانية يحوي حاليا على أكثر من 50% من بذور النباتات المحلية ، ويعتبر أكبر بنك للبذور في السلطنة. حيث يقوم الفريق بتجميع البذور من البرية ثم يقوم فريق آخر بتنظيفها من أجل تخزينها واستخدامها للزراعة. يقوم فريق بنك بالذور باستحداث تقنيات مختلقة لتنظيف الثمار والحصول على البذور النقية كما يقوم بأبحاث مستمرة لمعرفة صلاحية البذور وملائمة أماكن التخزين والعوامل الجوية لحفظها.